Em um arquivo de vídeo, imagem e som são faixas separadas dentro do mesmo contêiner. Remover o áudio não exige mexer na imagem: basta gravar um novo arquivo contendo só a faixa de vídeo.
É o que esta página faz com MP4 e MOV em H.264. A opção Áudio: Remover já vem marcada; ao exportar, os pacotes de vídeo são copiados para um novo MP4 e os de áudio não são escritos. A imagem fica idêntica à original e o arquivo sai um pouco menor.
Vídeo inteiro ou só um trecho
Ao abrir o arquivo, o trecho selecionado é o vídeo inteiro: se só quer tirar o som, exporte direto. Se quiser aproveitar para aparar o começo e o fim, arraste as alças na linha do tempo. No modo rápido o início vai para o keyframe anterior, como em todo corte por cópia.
Quando há recodificação
Se o vídeo não é H.264 (um WebM, por exemplo) ou se você mudar a proporção, a imagem precisa ser codificada de novo para caber em um MP4. O resultado informa qual caminho foi usado.